<th id="jw7p5"></th>
      1. <button id="jw7p5"></button>

        <button id="jw7p5"><acronym id="jw7p5"></acronym></button>
          <em id="jw7p5"><tr id="jw7p5"><u id="jw7p5"></u></tr></em>
          <li id="jw7p5"><acronym id="jw7p5"></acronym></li>

          1. 生物信息學服務
            LDA EffectSize分析 (LEfSE)
            【添加時間:2016-09-12 09:33:28】【來源:】【作者:dggadmin】
                    LEfSE分析可以實現多個分組之間的比較,還進行分組比較的內部進行亞組比較分析,從而找到組間在豐度上有顯著差異的物種(即biomaker)。
                    LDA值分布柱狀圖展現不同組中豐度有顯著差異的物種,柱狀圖的長度代表顯著差異物種的影響大小。進化分支圖由內至外輻射的圓圈代表了不同的分類級別(例如從界到屬)。每一個小圓圈代表該水平下的一個分類,小圓圈直徑大小與相對豐度大小呈正比。無顯著差異的物種統一著色為黃色,差異物種按分組顏色著色。
             
            \
            圖1  LDA值分布柱狀圖(A)和進化分支圖(B)

             
            \
            圖2 LEfSE分析顯示不同分組之間的種群豐度差異(以Acidobacteria門為例)

            參考文獻:Segata N, Izard J, Waldron L, Gevers D, Miropolsky L et al. (2011) Metagenomic biomarker discovery and explanation. Genome Biol 12: R60.10.1186/gb-2011-12-6-r60 PubMed: 21702898.



            上一篇:群落組成分析
            下一篇:共發生網絡(Co-occurrence)

            在线观看无码AV网站永久