<th id="jw7p5"></th>
      1. <button id="jw7p5"></button>

        <button id="jw7p5"><acronym id="jw7p5"></acronym></button>
          <em id="jw7p5"><tr id="jw7p5"><u id="jw7p5"></u></tr></em>
          <li id="jw7p5"><acronym id="jw7p5"></acronym></li>

          1. 生物信息學服務
            16S rRNA基因預測功能 (PICRUSt)
            【添加時間:2016-09-12 09:36:06】【來源:】【作者:dggadmin】
                    PICRUSt可以根據16S rRNA基因測序數據預測樣品中的微生物功能類別相對豐度。該分析適用于腸道、口腔等菌群多樣性較低的樣品,土壤樣品由于菌群結構復雜、未培養菌比例高,預測效果不理想。
             

            \
            圖1:用PICRUSt 預測的KEGG Orthology (KO)數據庫功能類別的相對豐度

            \
            圖2:PICRUSt 分析流程


            \
            圖3:PICRUSt預測細菌和古菌的準確性(外圈簇的高度表示準確性)

             
            \
            圖4:PICRUSt 對不同樣品的預測效果

            參考文獻:Langille, M. G.I.*; Zaneveld, J.*; Caporaso, J. G.; McDonald, D.; Knights, D.; a Reyes, J.; Clemente, J. C.; Burkepile, D. E.; Vega Thurber, R. L.; Knight, R.; Beiko, R. G.; and Huttenhower, C. Nature Biotechnology, 1-10. 8 2013.



            上一篇:共發生網絡(Co-occurrence)
            下一篇:最后一頁

            在线观看无码AV网站永久